Основными медицинскими противопоказаниями к назначению контактных линз для коррекции зрения являются воспалительные заболевания переднего отрезка глаза. К ним относятся рецидивирующие кератиты (например, герпетические), склериты, увеиты, при которых механическое раздражение и гипоксия, вызванные ношением линз, могут обострить заболевание.

Одним из основных недостатков контактных линз дневного ношения, как указывалось выше, является необходимость ежедневно надевать и снимать их. Но есть категория больных, которые не могут манипулировать линзами (пожилые пациенты, маленькие дети и пр.). Поэтому были разработаны линзы постоянного ношения, которые можно носить, не снимая, более 24 часов. В качестве линз постоянного ношения в настоящее время широко распространены линзы с высокой кислородопроницаемостью (высокогидрофильные) - тонкие и сверхтонкие МКЛ.