Микроскопия живого глаза является дополнением к другим общеизвестным методам исследования глаза. Поэтому биомикроскопии, как правило, должен предшествовать обычный офтальмологический осмотр больного. После собирания анамнеза обследуют пациента при дневном освещении, при помощи метода бокового фокального освещения, производят исследование в проходящем свете, офтальмоскопию. Функциональные исследования глаза (определение остроты зрения, периметрия) также должны предшествовать биомикроскопии. Если исследование функций глаза производится после биомикроскопии, то это приводит к получению ошибочных данных, так как после воздействия сильного света щелевой лампы, даже кратковременного, показания зрительных функций будут занижены.