Под настройкой щелевой лампы понимают такую взаимную установку частей прибора перед началом исследования, при которой фокус микроскопа (с учетом рефракции глаз наблюдателя и избранного увеличения) совмещается в пространстве с фокусом осветителя, т. е. помещается точно над осью колонки штатива. Для ЩЛ-56 предварительная точная настройка прибора имеет особенное значение, так как в процессе исследования ее дефекты трудно обнаружить.
При исследовании прозрачных сред глаза можно использовать широкий пучок света, но преимущества фокального освещения при биомикроскопии роговицы, передней камеры, хрусталика или стекловидного тела выступают особенно наглядно, если пользоваться узким, четко очерченным пучком света. Для этого нужно знать особенности оптической картины, возникающей при прохождении узкого пучка света через прозрачные и полупрозрачные ткани глаза и уметь очень точно настраивать на них прибор.